Das Historische Museum Kretas wurde 1953 von der Gesellschaft für die Kretischen Historischen Forschungen (EKIM) gegründet. Für dieses Museum wurde das neoklassizistische Gebäude unter Denkmalschutz der Familie Andreas und Maria Kalokerinou (1903) von der Stiftung A. & M. Kalokerinou nach dem Willen von dem Erblasser überlassen.

Ziel der EKIM, die das Historische Museum Kreta gründete und führt, ist die Bewahrung und Vorstellung der Kulturerbe Kretas von den ersten Byzantinischen Jahren bis heute. Dieses Ziel wurde graduell mit der Sammlung, dem Kauf, Schenkungen sowie dem Vorrat von Gegenständen von dem Kulturministerium erreicht.

Das Historische Museum war von Anfang an durch seine Innovation gekennzeichnet. Seine aufeinander folgenden Erweiterungen und die letztlichen Wiederausstellungen aus modernen museologischen Perspektiven und mit elektronischen Anwendungen trugen zu seiner Umwandlung in ein lebendiges, besucherfreundliches, modernes Museum. Heutzutage bietet das Historische Museum Kretas eine umfassende Vorstellung der Geschichte und der Kunst Kretas aus der frühchristlichen Zeit bis zu dem 20. Jahrhundert.

Die Wechselausstellungen decken ein breites Spektrum von der Byzantinischen bis der modernen Kunst, dem Aufstieg von großen literarischen Figuren Griechenlands (Elytis, Kazantzakis), der Vorstellung wichtiger historischer Ereignisse vom Ende des 19. Jahrhunderts bis zum Zweiten Weltkrieg. Dementsprechend stellen die ständig bereicherten, kostenlosen Bildungsprogramme eine kreative Lehrquelle im Zusammenhang mit den Dauerausstellungen und den Wechselausstellungen des Museums dar.

Lektüren, wissenschaftliche Symposien, Filmvorführungen und Buchvorstellungen, die in der Aula des Historischen Museums Kretas stattfinden, ergänzen seine Tätigkeiten und machen es zu einer extravertierter, vielseitiger Kulturinstitution.